三个月来一次月经的原因有可能是遗传因素、内分泌失调、子宫内膜壁比较薄等因素所导致，还需要到医院通过抽血和彩超检查等来明确病因。
1、遗传因素：月经来潮的时间和遗传因素是有一定关系的，会遗传母亲的基因，如果母亲三个月来一次月经的情况下，就有可能会遗传给孩子，导致孩子也会出现月经间隔时间比较长。
2、内分泌失调：内分泌失调会导致体内的激素水平出现不正常，在体内的雌激素分泌不足之后有可能会影响到子宫内膜的生长，也可能会造成月经不来潮的情况。可在医生指导下通过口服雌二醇片、地屈孕酮片、黄体酮胶囊等药物治疗。
3、子宫内膜壁比较薄：如果经过了多次的宫腔手术之后，就有可能会对子宫内膜壁造成损伤，以后造成子宫内膜并不能正常的生长和脱落，从而影响了月经周期。可以通过饮食调理的方法来做改善，比如多吃一些雌激素，含量丰富食物。
除了以上原因，也不排除是子宫内膜炎疾病所导致，还需要尽快治疗才能改善。
