月经后有异常的褐色分泌物的原因除了排卵期出血的因素外，主要是经期前后两到三天左右时，因盆腔充血，阴道分泌物增多，白带也多，有时还略带血色，黄体功能不足时会导致月经后有褐色分泌物。月经后有褐色分泌物还有可能是妇科炎症的表现。经血暗红有血块,属“血瘀气滞”体质，可用川芎、丹参、红花等材料。若经血少色淡，属于“血虚体虚”要用当归、黄芪、熟地、桂圆人参等补身体。
同时也可能是器质病变或药物等引起，包括生殖器官局部的炎症、肿瘤及发育异常、营养不良以及颅内疾患，其他内分泌功能失调如甲状腺、肾上腺皮持功能异常、糖尿病、席汉氏病等；肝脏疾患；血液疾患等。使用治疗精神病的药物，内分泌制剂或采取宫内节育器避孕者均可能发生月经不调。
但也有可能是神经内分泌功能失调引起的，主要是下后脑-生茶杯-卵巢轴的功能不稳定或是有缺陷，即月经病。或者是与精神心理方面的因素有关系，比如情绪长时间过度紧张、工作压力大等。
