宫颈囊肿和附件囊肿主要的区别是生长位置不同、性质不同、治疗方式不同等。1、生长位置：宫颈囊肿是生长在宫颈部位的囊肿，而附件囊肿，多数是生长在卵巢附件部位的囊肿。2、性质不同：宫颈囊肿多数是病理性的，而附件囊肿有一部分是生理性的。3、治疗方式