巧克力囊肿月经期间应该要注意保暖、药物治疗、手术治疗等方法来进行改善。1、注意保暖：在巧克力囊肿发作期间，不可以受凉，更不能吃辛辣刺激性食物，如果腹部出现疼痛的情况下，可以通过姜糖水以及局部热敷的方法来进行治疗。2、药物治疗：巧克力囊肿发作