男性尿道里面有小疙瘩可能是龟头炎、尿路感染、尖锐湿疣等原因所引起。1、龟头炎：在平时如果没有做好尿道部位卫生，可能会导致龟头炎出现，所以会导致尿道口部会出现许多小红疙瘩，可以在医生指导下通过克霉唑乳膏、硝酸咪康唑乳膏、特比萘芬乳膏等药物治疗