小便后睾丸疼痛的主要病因包括睾丸炎、泌尿系统感染、睾丸囊肿等，需要根据病因对症治疗。1、睾丸炎：睾丸炎主要是细菌、病毒以及衣原体等感染导致的，通常会出现睾丸急性疼痛与肿胀，还会伴有高热的症状，因此会引起小便后睾丸疼痛。若是细菌感染引起的，可