怀孕四十天有褐色分泌物腰酸可能是正常现象、阴道炎、异位妊娠等因素导致的，需要及时到医院查明病因后针对性的治疗。1、正常现象：怀孕早期会有褐色的分泌物，主要是由于受精卵着床造成，是属于正常现象的，一般不需要过多的担心。2、阴道炎：可能是由于阴