月经三天后同房一般是安全的。正常情况下月经干净三天后，宫腔及阴道残留的内膜组织已经排出干净，此时宫颈处在闭合的状态，此时夫妻同房一般是安全的。如月经刚刚干净，宫颈口处在微开的状态，此时同房病原体会通过宫颈口侵入宫腔，引起阴道炎、子宫内膜炎等妇科疾病，严重者还会引发不孕。
但要注意同房前后 卫生，建议双方进行清洗，避免产生交叉感染。如平时月经周期不规律，需做好避孕措施，以免意外怀孕，给自身健康造成危害。
