卵巢囊肿和巧克力囊肿一般具有病因不同、症状不同、使用药物不同等区别，需要积极配合医生进行治疗。1、病因不同：卵巢囊肿可能是环境污染、高胆固醇饮食等原因导致的。巧克力囊肿常常是遗传因素、经血逆流等原因引起的。2、症状不同：卵巢囊肿常常出现下腹