卵巢囊肿和巧克力囊肿一般具有病因不同、症状不同、使用药物不同等区别，需要积极配合医生进行治疗。
1、病因不同：卵巢囊肿可能是环境污染、高胆固醇饮食等原因导致的。巧克力囊肿常常是遗传因素、经血逆流等原因引起的。
2、症状不同：卵巢囊肿常常出现下腹胀满感、压迫感等症状。巧克力囊肿可能出现月经异常、痛经等症状。
3、使用药物不同：卵巢囊肿可以遵医嘱使用青霉素V钾片、甲硝唑片等药物进行治疗。巧克力囊肿可以使用布洛芬缓释胶囊、达那唑胶囊等药物辅助改善。
除此之外，还具有恢复时间不同、日常护理不同、手术方式不同等区别，治疗过程中，如果出现不适症状，建议及时到正规医院就诊。
